Yenidoğanlarda total protein ve albuminin plazma konsantrasyonları düşüktür ve ilaçların proteine bağlanması azalır. Bu durumda, ilaçların ölçülen total kan konsantrasyonu (proteine bağlı ve serbest kısımların toplamı) terapötik sınırlar içinde olduğu halde serbest drog miktarı fazla olduğundan toksik belirtiler ortaya çıkabilir.

İlaçların eliminasyonu, karaciğer ve böbrekler yoluyla gerçekleşir. Karaciğerde drog metabolizması iki basamaklıdır. Birinci fazda ilaç molekülü suda iyi eriyen bir metabolite dönüşür, ikinci fazda ise metabolitler endojen moleküllerle konjuge edilir. Birinci faz reaksiyonları (oksidasyon, reduksiyon ve metilasyon) 6. ayda maksimal matürasyona ulaşır. Yenidoğanlarda teofilinin ancak %10'u kafeine dönüşüp, %50'si değişmeden idrarla atılırken hepatik enzimlerin gelişmesi ile teofilin klirensi artar ve ilacın yarılanma ömrü süt çocuklarında 3-5 (erişkinde 8 saat) saate iner. Karaciğerdeki ikinci faz reaksiyonları (glukronidasyon, asetilasyon, sulfasyon) yenidoğanda erişkindekinin %50-70'i kadardır. Glukronid yapımı ancak 3-4 yaşlarında erişkin düzeyine erişir.

Böbrek fonksiyonları yaşla ilişkilidir. Yaşamın ilk günlerinde glomerüler filtrasyon hızı (GFR), vücut yüzeyine göre düzeltilse bile erişkindekinin 1/3'ü kadardır. Birinci haftanın sonunda GFR %50 artar ve bir yaşında erişkin değerine ulaşır. Bu durum, böbrek yoluyla atılan ilaçların dozlarının hesaplanmasını etkiler. Örneğin, gentamisin yenidoğanlarda ilk haftada 5mg/kg/gün miktarında ve ikiye bölünerek kullanılır. Yedi günlükten büyük süt çocuklarında ise günlük doz 7.5 mg/kg'dır ve üçe bölünmesi uygundur. Benzer şekilde digoksinin böbrek klirensi yenidoğanda 33 ml/dak/1.73m² iken üç aylık süt çocuklarında 98 ml/dak/1.73m²'ye yükselir.

Fizyolojik faktörlerin yanısıra hastalıklar da ilaçların kinetiğini etkiler.
Malnutrisyonlu süt çocuklarında serum albumin düzeyinin düşüklüğü nedeniyle fentoin ve ibuprofen gibi ilaçlar proteine bağlanamadıkları için serbet ilaç konsantrasyonu yükselir. Yenidoğandaki fizyolojik GFR düşüklüğünün dışında çocuklarda değişik nedenlere bağlı böbrek yetersizliği ortaya çıkabilir. Bu durumda ilaç dozlarının ayarlanmasında, erişkinler için hazırlanmış doz tablolarından yararlanılabilir. Tablolarda, verilecek ilaç miktarları ve doz aralıkları hastanın kreatinin klirensine göre düzenlenmiştir. Çocuklarda erişkindekine benzer biçimde 1.73 m² vücut yüzeyine göre dakikalık kreatinin klirensi pratik olarak aşağıdaki formüle göre hesaplanabilir: